如何检查BioPerl是否正确安装

为了检查BioPerl是否安装正确,我们可以使用perldoc命令来看一下。

如果你是Linux系统,随意打开一个终端;如果用的是Windows系统,那么打开命令提示符。输入以下命令:

[bash]

perldoc Bio::SeqIO

[/bash]

以上命令的作用是查看Bio::SeqIO模块的文档是否存在,如果存在,则会有相应的文档输出,则你安装Bio::SeqIO模块;如果没有,说明Perl找不到该模块,你还没有安装Bio::SeqIO模块。

引物Bio::SeqIO是BioPerl的基础模块,所以,你懂的,其它的一些模块也可以的,比如Bio::Seq  Bio::SearchIO等等。

此外,对于Perl的其它模块是否正确安装,也可以用perldoc命令检查一下。比如Bio::Graphics模块,并不保护在BioPerl的“安装包”内,所以对于要使用Gbrowser的同学来讲,需要手动安装该模块。

 

新年到了,祝看到这篇文章的同学新年快乐。

Happy new year!

 

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