使用BioEdit生成和绘制蛋白质进化树 虽然方法简单、上手快，但是由于 BioEdit 功能有限，使用起来很不方便。如果经常进行类似分析，那还是要使用 MEGA 6 这一个系统进化分析的“大杀器”。 第一步：下载和安装 MEGA 6。各平台均有发行版，在此不再赘述。 第二步：多序列比对，这是构建系统进化树的必要条件。 点击第一个按钮，选择 Edit/Build Alignment。 正如题目所说 … 阅读全文 →

使用Bio::Tree::Draw::Cladogram 输出的 EPS 文档在很多 EPS 查看软件（如Windows下面的ACDsee，gsView等）中不能打开，经查是由于 BoundingBox 出现浮点数所致，具体设计的代码为 Cladogram.pm 的 new 方法和 print 方法，简便起见，可以在原先的 443 行代码前面添加两行代码，以解决该问题。 如下所示 ： [perl] … 阅读全文 →