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使用BioPerl和primer3批量设计RT-PCR引物

2010-11-12 gaoch
𝕌pdate: 我已经设置了一个Massive RT-PCR Primer Designer服务,有需要的朋友可以直接去上传自己基因序列的Fasta文件,然后服务器会将引物返回。 关于Missing SEQUENCE tag错误的处理 以下为原文。 ———————————————————————————————– 本文介绍批量设计RT-PCR引物的方法,基于Ubuntu 10.10系统 … 阅读全文 →

Ubuntu 10.10环境下安装GScribble

2010-10-28 gaoch
𝔾Scibble是Linux下面的优秀的博客程序客户端,比Blogtk界面友好。可以读取Wordpress的分类信息,还可以编辑已发布的条目。 为了在我的Ubuntu 10.10环境下安装该程序,我还是处理了几个小问题,在这里Mark一下。 首先,安装过程中的问题。 安装文件可以从SF下载:http://sourceforge.net/projects/gscribble/ 按照安装文 … 阅读全文 →

关于GFF3格式

2010-10-28 gaoch
𝔾FF3是GFF注释文件的新标准。文件中每一行为基因组的一个属性,分为9列,以TAB分开。 依次是: 1. reference sequence:参照序列 指出注释的对象。如一个染色体,克隆或片段。可以有多个参照序列。 2. source :来源 注释的来源。如果未知,则用点(.)代替。 3. type :类型 属性的类型。建议使用符合SO惯例的名称(sequence ontology,参 … 阅读全文 →

重新安装bioperl

2010-10-28 gaoch
此文适合一下情况: 更新BioPerl时,想彻底删除旧版程序,安装一个完整的全新BioPerl; 安装BioPerl后出错,需要从头安装。 重新安装时不会自动覆盖老板本,因此需要手动删除以下文件: bioperl位于以下目录: /usr/local/man/man3/Bio::* /usr/local/bin/bp_* /usr/local/man/man1/bp_* … 阅读全文 →

Bio-Rad iQ5 vs. Opticon Monitor

2010-10-22 gaoch
使用 Bio-Rad 两款RT-PCR产品的评价 最近做了两次RT-PCR实验,实验所用的仪器都是伯乐公司的产品,一个小型点的拥有48孔平板,一个大点的有标准的96孔平板。硬件方面操作不必多说,想不到软件居然也不一样。所以这里单独谈谈软件。这两款软件分别是 iQ5 和 Opticon Monitor 。 iQ5 的反应缓慢 所用的文件格式很容易损坏 界面也不友好 Opticon Monitor响应 … 阅读全文 →

向量和矩阵有什么区别

2010-10-22 gaoch
向量和矩阵有什么区别 向量是矩阵的特殊类型,是只有一行或者一列的矩阵。这两种矩阵分别称为行矩阵(行向量)和列矩阵(列向量)。 另外,矩阵用阶数表示,比如2阶方阵;向量通常用维数表示,比如n维向量。 总之,向量的本质是矩阵,向量的计算全部参考矩阵计算的运算律。 Posted from GScribble. 阅读全文 →

[转载]智利矿工营救:专业精神的胜利

2010-10-18 gaoch
𝕙ttp://taoduanfang.blog.163.com/blog/static/25091713201091634351119/?blog 刚刚听到智利矿工获救的消息,又传来国内平煤集团四矿瓦斯爆炸的消息。 我们的矿工,什么时候才能享有如此的待遇呢? 智利矿工营救:专业精神的胜利 智利当地时间10月13日0点11分,被困井下69天的圣何塞铜金矿33名矿工中的第一位、31岁的工头弗洛伦西奥. … 阅读全文 →

测试:使用BloGTK发表文章

2010-10-17 gaoch
这是使用BloGTK 1.1发表的文章。 通过XML-RPC协议,可以方便的发表文章,而不用登录后台。这在网络条件差的时候尤为方便。 阅读全文 →

从叶县坐飞机去平顶山

2009-12-06 gaoch
从叶县坐飞机去平顶山 http://hi.baidu.com/%D7%F3%D3%EF%D3%B1/blog/item/057688dc176303d18c1029f7.html “到平顶山多少钱?”“二十块二十块,木你是头回坐飞机?”售票员不耐烦地吐出一口瓜 子壳。“咋恁贵?不都是十五块钱门?”“你说那是求,啥时候也秒卖过十五块。瞅瞅,这可 是国营飞机场!”说着,把贴着"国 … 阅读全文 →

卸磨杀驴

2009-09-13 gaoch
刚刚安装了电驴,启动程序时看到了“卸载电驴”的选项,觉得应该改成“卸磨杀驴”。 那就有意思多了,哈哈! 阅读全文 →