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Massive RT-PCR Primer Designer is online
2016-01-16
gaoch
𝕋he Massive RT-PCR Primer Designer is based on Primer3 and BioPerl toolbox, and was derived from the standalone codes which have been discussed by two previous blog posts (Post 1 and Post 2). …
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ContigExpress-Assemble pair-end sequencing fragments
2016-01-12
gaoch
送样测序的时候,测序公司会问你是否要从两端测通?如果你选择两端测通,可能会得到两个序列(也可能测序公司已经帮你拼接成一条序列了),这时候你需要将这两条序列拼接起来。
我们使用ContigExpress这个程序来完成这一任务。
ContigExpress是Vector NTI© Software中的一个组件,可以在这里下 …
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A Genbank –> GTF converter derived from BioPerl
2015-10-14
gaoch
𝔹ioPerl has a Genbank –> GFF converter (the script is bp_genbank2gff3.pl), however, this converter generated GFF/GTF file could not work in Bioconductor when using the function maketxdbfromGFF to …
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A Genbank to BED converter
2015-10-14
gaoch
𝕃ike the previous Genbank -> GTF converter, this script is also depended on BioPerl, so you need firstly get the module installed in your system (Install BioPerl). To check whether BioPerl is …
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cloudfs无法上传的故障排除
2015-09-27
gaoch
之前设置WordPress使用阿里云OSS存储图片,今天出问题了。设置方法在这里
错误提示:cannot access oss: Transport endpoint is not connected
解决方案如下:
[…] [cc lang=”bash”]
umount /mnt/oss
service cloudfs restart
chmod 666 /mnt/oss …
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使用自定义过滤器筛选PubMed的搜索结果
2015-09-27
gaoch
在PubMed中按影响因子查看文献。使用自定义的Filter,能够帮助你快速定位重要文献,排除小文章。
最终的结果像这个样子,在你的PubMed搜索结果中,会出现“IF>2”,“IF>5”,“IF>10”等选项。
设置步骤如下:
1)登录NCBI账号,如果没有,就注册一个。
2)在PubMed中随意搜索,过滤器会显示在结果右侧。
3)点击“Manage Filter”,进入设置页 …
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InbR, a TetR family regulator, binds with isoniazid and influences multidrug resistance in Mycobacterium bovis BCG
2015-09-11
gaoch
在Scientific Reports上面的一篇论文昨天(2015-9-10)上线了。我是第二作者,负责了ChIP-seq实验等少部分实验,全部的生物信息学分析,论文撰写、修订和投稿等事宜。该研究最初投稿的是核酸研究杂志,被拒稿后由我接手,转投Scientific Reports,前后耗费了2个多月终于接受。除了正文中,附件也有不少数据,特别是一个大Table。 …
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富士卡片机F60fd拆机图片
2015-09-06
gaoch
友情提示:依本文拆机相机未获修复的,不承担连带责任哦!
按:我的富士F60fd镜头落地摔歪了,所以才拆机。
[…] 去掉侧面板
去掉显示屏
去掉金属板
[…] 主板有上下两块,之间由插槽接口连接,小心撬开主板,去掉排线,拿下主板。
这个是取下的主板。
[…] 摘下排线,取下镜头组件。
这是镜头组件,含有镜头、快门、CCD等元件。
[…] 揭下 …
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整合 OSS 开放存储到 WordPress 系统
2015-08-23
gaoch
使用 OSS 存储 WordPress 相当于将 云服务器 的存储免费扩大了。
[…] -在云市场搜索cloudfs,获取下载链接。
-将下载的安装包上传至云服务器。
-安装依赖包。
-以默认设置安装。
[cc lang=”bash”]
# Install dependence
apt-get install libcurl4-openssl-dev libssl-dev …
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Ubuntu 快速安装 LAMP
2015-08-21
gaoch
[cc lang=”bash”]
sudo apt-get install tasksel
# 任务标记分组
sudo tasksel install lamp-server
#安装途中MySQL要求设定账户有密码,这是与操作系统没关系的账户与密码。
[/cc]
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