————————————————————————————————————- 我先前曾经写过一个设计RT-PCR引物的脚本，当初运行良好，所以把它给分享了出来（在这里）。最近又用发现会有错误，“Missing SEQUENCE tag”，经过分析，最终解决了这个问题。 方法如下： [cc lang=’bash’]sudo gedit … 阅读全文 →

人们使用数据库管理数据，对于生物数据来说，一个优秀的数据库有以下优点： 然而，生物数据的迅速增大，带来很多问题： 相对来说，NCBI收录生物数据时力求完整不遗漏，所以数据库内容是冗余的，有很多重复性条目，无意义条目。 与之相对的，SwissProt数据库则力求注释完整，在收录数据会进行合并和归档，以保证量不重复。 阅读全文 →

𝔾FF3是GFF注释文件的新标准。文件中每一行为基因组的一个属性，分为9列，以TAB分开。 依次是： 1. reference sequence：参照序列 指出注释的对象。如一个染色体，克隆或片段。可以有多个参照序列。 2. source ：来源 注释的来源。如果未知，则用点（.）代替。 3. type ：类型 属性的类型。建议使用符合SO惯例的名称（sequence ontology，参 … 阅读全文 →