生物学 BIOLOGY

关于GFF3格式

2010-10-28 gaoch
𝔾FF3是GFF注释文件的新标准。文件中每一行为基因组的一个属性,分为9列,以TAB分开。 依次是: 1. reference sequence:参照序列 指出注释的对象。如一个染色体,克隆或片段。可以有多个参照序列。 2. source :来源 注释的来源。如果未知,则用点(.)代替。 3. type :类型 属性的类型。建议使用符合SO惯例的名称(sequence ontology,参 … 阅读全文 →

Bio-Rad iQ5 vs. Opticon Monitor

2010-10-22 gaoch
使用 Bio-Rad 两款RT-PCR产品的评价 最近做了两次RT-PCR实验,实验所用的仪器都是伯乐公司的产品,一个小型点的拥有48孔平板,一个大点的有标准的96孔平板。硬件方面操作不必多说,想不到软件居然也不一样。所以这里单独谈谈软件。这两款软件分别是 iQ5 和 Opticon Monitor 。 iQ5 的反应缓慢 所用的文件格式很容易损坏 界面也不友好 Opticon Monitor响应 … 阅读全文 →