统计学

样本水平富集分析

2025-11-26 gaoch
样本水平富集分析 (Sample-Level Enrichment Analysis, SLEA) 是一种用于分析转录组数据集中每个样本内基因模块(或称基因集,如通路)转录状态的方法。 […] 逐样本分析: 与传统的基因集富集分析 (GSEA) 不同,传统的 GSEA 通常是比较两组样本(例如,疾病组与正常组)之间基因集的富集情况,而 SLEA 是对数据集中的每个独立样本计算其特定基 … 阅读全文 →

GSEA原理及其在微生物组数据的广义化应用

2025-11-21 gaoch
𝔾SEA(Gene Set Enrichment Analysis,基因集富集分析)是一种基于阈值的计算方法,其核心统计学目标是判断一个预先定义的基因集(Gene Set)内的基因,是否在两个生物学状态(例如肿瘤组织 vs 正常组织)的基因表达排序列表中呈现非随机的排列。不同于传统的差异表达分析(只关注差异显著的少数基因),GSEA关注的是整个基因表达谱的整体趋势,利用加权柯尔莫哥洛夫-斯米尔诺 … 阅读全文 →