解决方案如下： […] 主要代码如下： bp_genbank2gff3 --GFF_VERSION 3 file.gb awk '$3!~/pseudo/' file.gb.gff > file.rsem.gff # or more restrictly with only protein coding genes awk … 阅读全文 →

𝔾FF3是GFF注释文件的新标准。文件中每一行为基因组的一个属性，分为9列，以TAB分开。 依次是： 1. reference sequence：参照序列 指出注释的对象。如一个染色体，克隆或片段。可以有多个参照序列。 2. source ：来源 注释的来源。如果未知，则用点（.）代替。 3. type ：类型 属性的类型。建议使用符合SO惯例的名称（sequence ontology，参 … 阅读全文 →