Microbiome
STAMP: unknown error – Unicode encode error
2016-05-29
gaoch
𝕊TAMP是一个支持Windows、Linux系统的微生物群落分析软件。与Mothur或QIIME相比,感觉它更小巧、轻便。它没有从测序结果(MiSeq/454)出发直到分析结果的一整套流程,但是它具有从OTU Table出发进行统计分析、作图的能力。借助于scipy,numpy,matplotlib等Python库的支持,它的分析、绘图能力达到了一个非常令人满意的程度。相应结果基本可以直接在文章 …
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biom 格式
2016-05-26
gaoch
官方网址:http://biom-format.org/index.html
格式说明:http://biom-format.org/documentation/biom_format.html
biom 是The Biological Observation Matrix (BIOM) 的缩写。
[…] 这个格式是微生物生态研究中衍生出的文件格式,扩展名建议是*.biom, …
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