本文是我在华中农业大学JC Bioinformatics 2018暑期生物信息学培训班上的讲义 […] 原核转录组课程讲授利用RNA-seq方法研究细菌基因组中基因表达差异的原理和方法。课程中不仅介绍了RNA-seq生物信息学分析的内容，还对RNA-seq的原理、文库构建等湿实验进行解读。 为了降低学习门槛，课程中的实例取自公开发表的细菌基因组，但是这不意味着相关原理和方法不能应用于 … 阅读全文 →

解决方案如下： […] 主要代码如下： bp_genbank2gff3 --GFF_VERSION 3 file.gb awk '$3!~/pseudo/' file.gb.gff > file.rsem.gff # or more restrictly with only protein coding genes awk … 阅读全文 →