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Letter 1: On Saving Time
2015-07-23
Lucius Annaeus Seneca
𝔾reetings from Seneca to his friend Lucilius.
Continue to act thus, my dear Lucilius – set yourself free for your own sake; gather and save your time, which till lately has been forced from you, or …
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修复Bio::Tree::Draw::Cladogram 输出EPS BoundingBox错误的问题
2013-12-25
gaoch
使用Bio::Tree::Draw::Cladogram 输出的 EPS 文档在很多 EPS 查看软件(如Windows下面的ACDsee,gsView等)中不能打开,经查是由于 BoundingBox 出现浮点数所致,具体设计的代码为 Cladogram.pm 的 new 方法和 print 方法,简便起见,可以在原先的 443 行代码前面添加两行代码,以解决该问题。
如下所示 :
[perl] …
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对湖北工业大学校训的理解
2012-09-05
gaoch
湖北工业大学是我第一个工作单位,其校训为“厚德博学,求实创新”。作为一个新员工,多少对其有些想法,记录如下:
且不论国内高校校训多毫无个性,被广泛誉为“八个字”,只从其含义来进行理解。
这八个字,两两为伍,所以先一一分析。
先看——厚德博学。
这两个词很有意思,在我看来,似乎有种辩证统一、互为补充的含义。所谓厚德,即要求一个人在德行上有所建树,这是对精神层面的要求。然而,仅仅具有高尚的品德,而无专 …
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在Ubuntu 12.04系统中安装LAMP(网络服务器套件)并设置rewrite
2012-08-23
gaoch
打开终端,输入以下命令,一键完成安装:
[bash]sudo apt-get install apache2 php5
libapache2-mod-php5 mysql-server
libapache2-mod-auth-mysql php5-mysql
phpmyadmin[/bash]
[…] 请安装提示根据需要设置密码。
[…] 一键打开 Rewrite: …
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fastq format – sra format
2012-08-21
gaoch
𝕗astq格式与fasta格式相同的一点在于它们都是文本格式,不同之处在于前者提供了测序质量等更多的信息,而后者仅仅能提供序列(前者也提供序列)。
[…] FASTQ format is a text-based format for storing both a biological sequence (usually nucleotide sequence) and its …
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在Ubuntu环境中设置Bowtie
2012-08-20
gaoch
什么是Bowtie?What is Bowtie?
[…] Bowtie is an ultrafast, memory-efficient short read aligner geared toward quickly aligning large sets of short DNA sequences (reads) to large genomes. It aligns …
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生物信息学中的 SAM 格式介绍
2012-08-16
gaoch
𝔽ollowing is a brief description of the SAM format as output by bowtie when the -S/–sam option is specified. For more details, see the SAM format specification.
When -S/–sam is specified, bowtie …
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MatLab中国地图进阶:以不同的颜色表示各省数据的差异
2012-06-05
gaoch
使用MatLab绘制中国地图十分方便,我在前文中已经有相应阐述。实际应用中,我们常常需要将不同的区域以不同的颜色展示出来,这就是本文要阐述的内容。
本文使用MatLab将各省人口数据展示出来,人口越多颜色越黄,人口越少颜色越绿。最终结果如下图所示(点击看大图)。
绘制过程如下:
[…] %-- 分省中国地图在MATLAB中的画法 --% % Author: …
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the_content()和the_excerpt()
2012-06-05
gaoch
这是wordpress中用以提取post内容的常用函数。它们用法基本相同,很多时候可以相互取代,分别用于显示post全部内容和post摘要。
然而,事实上在应用中它们最大的区别在于,前者输出格式化的内容,而后者则输出文字(格式错乱,没有超链接,换行,样式定义等)。所以,大多数时候,我只用前一个函数。
有些主题作者喜欢用the_excerpt()(特别是在分类列表中),我常常将其改 …
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删除Zotero自动生成的Tags或关键词
2012-03-14
gaoch
添加项目时,Zotero默认将关键词以Tag的形式加入,这样可以快速的查看与某一关键词相关的条目。可是自动加入的Tag或关键词有太多太多,时间一长,Zotero数据库中会产生成百上千个关键词或Tag,导致其失去了便于检索的应用价值。
所以,建议在取消该选项,而改为人工添加更加简单易记的关键词或Tag。
那么,对于已经存在的Tag如何一下子全部删除呢?按照下面的步骤操作即可。
[…] …
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