在网上看到了一个从国家地理杂志网站下载每日图片的Perl程序。因为网站改版，脚本已经不能正常运行，经过修改后，经测试可以将每日图片下载到当前目录，代码如下： #!/usr/bin/perl # author: # Seraphxby # Purpose: # 查看国家地理每日图片的Perl脚本 # history: # v0.1 first draft # 2010-12-8 modified … 阅读全文 →

𝕌pdate： 我已经设置了一个Massive RT-PCR Primer Designer服务，有需要的朋友可以直接去上传自己基因序列的Fasta文件，然后服务器会将引物返回。 关于Missing SEQUENCE tag错误的处理 以下为原文。 ———————————————————————————————– 本文介绍批量设计RT-PCR引物的方法，基于Ubuntu 10.10系统 … 阅读全文 →

𝔾FF3是GFF注释文件的新标准。文件中每一行为基因组的一个属性，分为9列，以TAB分开。 依次是： 1. reference sequence：参照序列 指出注释的对象。如一个染色体，克隆或片段。可以有多个参照序列。 2. source ：来源 注释的来源。如果未知，则用点（.）代替。 3. type ：类型 属性的类型。建议使用符合SO惯例的名称（sequence ontology，参 … 阅读全文 →

此文适合一下情况： 更新BioPerl时，想彻底删除旧版程序，安装一个完整的全新BioPerl； 安装BioPerl后出错，需要从头安装。 重新安装时不会自动覆盖老板本，因此需要手动删除以下文件： bioperl位于以下目录： /usr/local/man/man3/Bio::* /usr/local/bin/bp_* /usr/local/man/man1/bp_* … 阅读全文 →

使用 Bio-Rad 两款RT-PCR产品的评价 最近做了两次RT-PCR实验，实验所用的仪器都是伯乐公司的产品，一个小型点的拥有48孔平板，一个大点的有标准的96孔平板。硬件方面操作不必多说，想不到软件居然也不一样。所以这里单独谈谈软件。这两款软件分别是 iQ5 和 Opticon Monitor 。 iQ5 的反应缓慢 所用的文件格式很容易损坏 界面也不友好 Opticon Monitor响应 … 阅读全文 →

向量和矩阵有什么区别 向量是矩阵的特殊类型，是只有一行或者一列的矩阵。这两种矩阵分别称为行矩阵（行向量）和列矩阵（列向量）。 另外，矩阵用阶数表示，比如2阶方阵；向量通常用维数表示，比如n维向量。 总之，向量的本质是矩阵，向量的计算全部参考矩阵计算的运算律。 Posted from GScribble. 阅读全文 →

𝕙ttp://www.nature.com/nature/journal/v455/n7212/full/455460a.html 这一百个词的中译为： 酸碱、聚合状态、分析、反物质、组织、大气、原子、细菌、宇宙大爆炸、生物多样性、生物伦理、生物圈、黑洞、碳、细胞、混乱（态）、气候、克隆、DNA、生态系统、电、电子、元素、能量、熵、环境、酶、平衡、错误、行为学、进化、实验、力、化石、星系、基因、转 … 阅读全文 →

按：本文中，通过图片形象的描述着两种纯化的结合作用力，以及洗脱的原理。希望通过对这些图片的说明，可以帮助了解实验的原理。 his- tag所用层析凝胶的基质上连接了一个NTA（[=nitrilotriacetic acid]氮基三乙酸），可以与Ni离子结合，而Ni离子与融合蛋白的6Xhis氨基酸之间产生如图的吸引力，从而将带有his-tag组氨酸标签的融合 蛋白与其它蛋白区分开来。 从图中可以看 … 阅读全文 →

候选第二信使 还在不久之前，细菌细胞内的信号传送情景看来似乎是被人遗忘了。特别是传送第二信号的小分子似乎并不常见。它们限于cyclic adenosine 3’,5’-monophosphate (cAMP) ，（即环磷酸腺苷，其功能是发出葡萄糖浓度变化的信号）和guanosine-tetraphosphate (ppGpp) （即 鸟苷四磷酸盐 ，它是在对营养性应激进行反应时产生的 ）。环二核苷 … 阅读全文 →