旧文
Linux下命令行压缩照片或图片的脚本
2010-11-17
gaoch
硬盘空间不足。
有一些毕业时候拍摄的照片,量很多,每个都有2M多,非常占用空间。在windows下面,常常用光影魔术手进行批处理,在Linux下面,那就用到了imagemagick(翻译过来也是“图片魔术师”——说不定是光影魔术手的祖师爷呢,哈哈)。
安装imagemagick
[bash]
>sudo apt-get install imagemagick
[/bash]
压缩图片
最长边 …
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志哀:2010-11-15 上海大火
2010-11-17
gaoch
事件过去2天了。看着死难人尸体和现场图片,心中感觉怪怪的。看到人们在熏成通体黑色的楼底,放下鲜花,才感觉到一点安慰。
以此日志,致哀!
韩寒的博客:十一月大火的过程
网易图片报道:上海教师公寓火灾全程图片报道
嗨!历史:1911年,一场改变了美国的火灾
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使用BioPerl和primer3批量设计RT-PCR引物
2010-11-12
gaoch
𝕌pdate:
我已经设置了一个Massive RT-PCR Primer Designer服务,有需要的朋友可以直接去上传自己基因序列的Fasta文件,然后服务器会将引物返回。
关于Missing SEQUENCE tag错误的处理
以下为原文。
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本文介绍批量设计RT-PCR引物的方法,基于Ubuntu 10.10系统 …
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Ubuntu 10.10环境下安装GScribble
2010-10-28
gaoch
𝔾Scibble是Linux下面的优秀的博客程序客户端,比Blogtk界面友好。可以读取Wordpress的分类信息,还可以编辑已发布的条目。
为了在我的Ubuntu 10.10环境下安装该程序,我还是处理了几个小问题,在这里Mark一下。
首先,安装过程中的问题。
安装文件可以从SF下载:http://sourceforge.net/projects/gscribble/
按照安装文 …
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关于GFF3格式
2010-10-28
gaoch
𝔾FF3是GFF注释文件的新标准。文件中每一行为基因组的一个属性,分为9列,以TAB分开。
依次是:
1. reference sequence:参照序列
指出注释的对象。如一个染色体,克隆或片段。可以有多个参照序列。
2. source :来源
注释的来源。如果未知,则用点(.)代替。
3. type :类型
属性的类型。建议使用符合SO惯例的名称(sequence ontology,参 …
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重新安装bioperl
2010-10-28
gaoch
此文适合一下情况:
更新BioPerl时,想彻底删除旧版程序,安装一个完整的全新BioPerl;
安装BioPerl后出错,需要从头安装。
重新安装时不会自动覆盖老板本,因此需要手动删除以下文件:
bioperl位于以下目录:
/usr/local/man/man3/Bio::*
/usr/local/bin/bp_*
/usr/local/man/man1/bp_* …
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Bio-Rad iQ5 vs. Opticon Monitor
2010-10-22
gaoch
使用 Bio-Rad 两款RT-PCR产品的评价
最近做了两次RT-PCR实验,实验所用的仪器都是伯乐公司的产品,一个小型点的拥有48孔平板,一个大点的有标准的96孔平板。硬件方面操作不必多说,想不到软件居然也不一样。所以这里单独谈谈软件。这两款软件分别是 iQ5 和 Opticon Monitor 。
iQ5 的反应缓慢 所用的文件格式很容易损坏 界面也不友好
Opticon Monitor响应 …
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向量和矩阵有什么区别
2010-10-22
gaoch
向量和矩阵有什么区别
向量是矩阵的特殊类型,是只有一行或者一列的矩阵。这两种矩阵分别称为行矩阵(行向量)和列矩阵(列向量)。
另外,矩阵用阶数表示,比如2阶方阵;向量通常用维数表示,比如n维向量。
总之,向量的本质是矩阵,向量的计算全部参考矩阵计算的运算律。
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[转载]智利矿工营救:专业精神的胜利
2010-10-18
gaoch
𝕙ttp://taoduanfang.blog.163.com/blog/static/25091713201091634351119/?blog
刚刚听到智利矿工获救的消息,又传来国内平煤集团四矿瓦斯爆炸的消息。
我们的矿工,什么时候才能享有如此的待遇呢?
智利矿工营救:专业精神的胜利
智利当地时间10月13日0点11分,被困井下69天的圣何塞铜金矿33名矿工中的第一位、31岁的工头弗洛伦西奥. …
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测试:使用BloGTK发表文章
2010-10-17
gaoch
这是使用BloGTK 1.1发表的文章。
通过XML-RPC协议,可以方便的发表文章,而不用登录后台。这在网络条件差的时候尤为方便。
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