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从一组照片创建PPT
2017-11-15
gaoch
每次听讲座时,总是会把感兴趣的内容用手机拍摄下来。随后整理归纳成相应的报告PPT。以前都是一张张添加,今天发现了一种批量添加的方法。
新建一个PowerPoint文档,选择插入 –》 相册,指定目录,导入图片,点击“确定”就一气呵成了。使用图片工具将图片压缩之后,存放备查。十分方便。
[…] 参考资 …
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Windows系统中固定R的Library目录
2017-11-02
gaoch
每次R语言版本更新,都在Windows下面新安装一个目录,原来的Library无法继续使用。
通过设置R的环境变量,可以实现将R_LIBS_USER固定到一个地方。
在Linux系统中,方法很简单,只需要在~/.Rprofile文件中指定
R_LIBS_USER='~/Library/R' 在Windows下设置R_LIBS_USER的一个途径是 …
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清理Windows 10系统盘
2017-10-11
gaoch
𝕎indows最近发了个大更新。自国庆节期间更新系统之后,50G的系统盘已经几乎被填满了。Windows就是这么臃肿,越用越慢。这方面真是大不如Linux。用了几年的Ubuntu根目录才1G左右,简直把Windows吊打的渣都不剩。
吐槽归吐槽,但是还是不得不着手对系统进行清理。
首先打开系统自带的磁盘清理工具,19.2G的Windows.old清理之后,感觉清爽了不少。
其次,打开磁盘占用分析神 …
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在阿里云ECS上设置swap分区
2017-10-10
gaoch
对于内存比较小的ECS来说,开启swap可以避免偶尔的内存溢出。
#查看内存和虚拟分区情况 free -h #创建虚拟分区(1GB) dd if=/dev/zero of=/mnt/swap bs=1M count=1000 mkswap /mnt/swap #启用swap swapon /mnt/swap echo 10 > /proc/sys/vm/swappiness #查看swap …
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Origin:使用上标、下标、数学公式和希腊字母等特殊格式的文本
2017-06-21
gaoch
𝕆rigin是一个优秀的科学作图软件。在实际使用过程中,经常需要在坐标轴标签(Tick Label,axis label)中使用诸如上标、下标等特殊格式的文本。坐标轴标签可以直接用其中的内置编辑器,然而常用的Tick Label则一直不清楚如何设置。
那么,如何在Tick Label中使用特殊格式的文本呢?答案在于Origin提供的一系列格式化函数中。
[…] 如图所示,Origin …
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RSEM: rsem-prepare-reference with NCBI GenBank/GFF3 File
2017-06-01
gaoch
解决方案如下:
[…] 主要代码如下:
bp_genbank2gff3 --GFF_VERSION 3 file.gb awk '$3!~/pseudo/' file.gb.gff > file.rsem.gff # or more restrictly with only protein coding genes awk …
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Zotero: 标签的使用技巧
2016-12-22
gaoch
选中多个条目,拖动到左侧标签列表中即可。
[…] 用鼠标右键单击任一标签,选择设置颜色,可以为标签设置一个颜色和快捷键。快捷键最多可以有6个,分别是数字1-6。设置之后,可以点击数字1-6将选中条目设为所用标签,非常方便。
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适合制作PowerPoint报告时候使用的Zotero引文样式
2016-10-25
gaoch
我定制了一个Zotero样式,特别适合在PPT中使用。分享给大家。具体效果如下图所示。
在引用时,显示第一作者、期刊和出版年。在引文清单时,最多仅显示3个作者,多余3个将只显示第一作者。同时显示文章标题、期刊和卷、期等信息。
把这个csl文件拖放到Firefox窗口中即可安装。
使用时,先选择一个或多个文献条目,然后点击右键,选择“由所选条目创建引文目录…”。
[…] 在打开的窗口中 …
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STAMP: unknown error – Unicode encode error
2016-05-29
gaoch
𝕊TAMP是一个支持Windows、Linux系统的微生物群落分析软件。与Mothur或QIIME相比,感觉它更小巧、轻便。它没有从测序结果(MiSeq/454)出发直到分析结果的一整套流程,但是它具有从OTU Table出发进行统计分析、作图的能力。借助于scipy,numpy,matplotlib等Python库的支持,它的分析、绘图能力达到了一个非常令人满意的程度。相应结果基本可以直接在文章 …
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biom 格式
2016-05-26
gaoch
官方网址:http://biom-format.org/index.html
格式说明:http://biom-format.org/documentation/biom_format.html
biom 是The Biological Observation Matrix (BIOM) 的缩写。
[…] 这个格式是微生物生态研究中衍生出的文件格式,扩展名建议是*.biom, …
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