我定制了一个Zotero样式，特别适合在PPT中使用。分享给大家。具体效果如下图所示。 在引用时，显示第一作者、期刊和出版年。在引文清单时，最多仅显示3个作者，多余3个将只显示第一作者。同时显示文章标题、期刊和卷、期等信息。 把这个csl文件拖放到Firefox窗口中即可安装。 使用时，先选择一个或多个文献条目，然后点击右键，选择“由所选条目创建引文目录…”。 […] 在打开的窗口中 … 阅读全文 →

𝕊TAMP是一个支持Windows、Linux系统的微生物群落分析软件。与Mothur或QIIME相比，感觉它更小巧、轻便。它没有从测序结果（MiSeq/454）出发直到分析结果的一整套流程，但是它具有从OTU Table出发进行统计分析、作图的能力。借助于scipy，numpy，matplotlib等Python库的支持，它的分析、绘图能力达到了一个非常令人满意的程度。相应结果基本可以直接在文章 … 阅读全文 →

在PubMed中按影响因子查看文献。使用自定义的Filter，能够帮助你快速定位重要文献，排除小文章。 最终的结果像这个样子，在你的PubMed搜索结果中，会出现“IF>2”，“IF>5”，“IF>10”等选项。 设置步骤如下： 1）登录NCBI账号，如果没有，就注册一个。 2）在PubMed中随意搜索，过滤器会显示在结果右侧。 3）点击“Manage Filter”，进入设置页 … 阅读全文 →

使用 OSS 存储 WordPress 相当于将 云服务器 的存储免费扩大了。 […] -在云市场搜索cloudfs，获取下载链接。 -将下载的安装包上传至云服务器。 -安装依赖包。 -以默认设置安装。 [cc lang=”bash”] # Install dependence apt-get install libcurl4-openssl-dev libssl-dev … 阅读全文 →

最近将国外的主机迁移到了阿里云（参见：Site Changelog）。没办法，GFW太厉害了。留在外面只能做僵尸网站。 本文简要介绍了将WordPress迁移到云服务器ECS、云数据库RDS，域名绑定到云解析的方法。 如果要购买 ECS 云服务器，使用我的邀请码（U6FOVY，有效期截止 2015-11-30）可以得到 九折 优惠。 […] 安装LAMP：Ubuntu … 阅读全文 →

𝕊SPACE是一个常用的Scaffolding软件.当你有新的测序数据时,你可以使用SSPACE将原有的contigs延长,scaffolding等. 在Ubuntu 14.04系统中运行该软件v3.0会出现错误.谷歌也没有发现好的解决方法,最终通过研究源代码,发现这是一个简单的问题,修订源代码之后,终于能够成功运行. 两处修订如下: [cc lang=”perl”] #~ require … 阅读全文 →

使用Bio::Tree::Draw::Cladogram 输出的 EPS 文档在很多 EPS 查看软件（如Windows下面的ACDsee，gsView等）中不能打开，经查是由于 BoundingBox 出现浮点数所致，具体设计的代码为 Cladogram.pm 的 new 方法和 print 方法，简便起见，可以在原先的 443 行代码前面添加两行代码，以解决该问题。 如下所示 ： [perl] … 阅读全文 →

使用MatLab绘制中国地图十分方便，我在前文中已经有相应阐述。实际应用中，我们常常需要将不同的区域以不同的颜色展示出来，这就是本文要阐述的内容。 本文使用MatLab将各省人口数据展示出来，人口越多颜色越黄，人口越少颜色越绿。最终结果如下图所示（点击看大图）。 绘制过程如下： […] %-- 分省中国地图在MATLAB中的画法 --% % Author: … 阅读全文 →

这是wordpress中用以提取post内容的常用函数。它们用法基本相同，很多时候可以相互取代，分别用于显示post全部内容和post摘要。 然而，事实上在应用中它们最大的区别在于，前者输出格式化的内容，而后者则输出文字（格式错乱，没有超链接，换行，样式定义等）。所以，大多数时候，我只用前一个函数。 有些主题作者喜欢用the_excerpt()（特别是在分类列表中），我常常将其改 … 阅读全文 →

添加项目时，Zotero默认将关键词以Tag的形式加入，这样可以快速的查看与某一关键词相关的条目。可是自动加入的Tag或关键词有太多太多，时间一长，Zotero数据库中会产生成百上千个关键词或Tag，导致其失去了便于检索的应用价值。 所以，建议在取消该选项，而改为人工添加更加简单易记的关键词或Tag。 那么，对于已经存在的Tag如何一下子全部删除呢？按照下面的步骤操作即可。 […] … 阅读全文 →