Ubuntu

使用BioPerl和primer3批量设计RT-PCR引物

2010-11-12 gaoch
𝕌pdate: 我已经设置了一个Massive RT-PCR Primer Designer服务,有需要的朋友可以直接去上传自己基因序列的Fasta文件,然后服务器会将引物返回。 关于Missing SEQUENCE tag错误的处理 以下为原文。 ———————————————————————————————– 本文介绍批量设计RT-PCR引物的方法,基于Ubuntu 10.10系统 … 阅读全文 →

Ubuntu 10.10环境下安装GScribble

2010-10-28 gaoch
𝔾Scibble是Linux下面的优秀的博客程序客户端,比Blogtk界面友好。可以读取Wordpress的分类信息,还可以编辑已发布的条目。 为了在我的Ubuntu 10.10环境下安装该程序,我还是处理了几个小问题,在这里Mark一下。 首先,安装过程中的问题。 安装文件可以从SF下载:http://sourceforge.net/projects/gscribble/ 按照安装文 … 阅读全文 →

重新安装bioperl

2010-10-28 gaoch
此文适合一下情况: 更新BioPerl时,想彻底删除旧版程序,安装一个完整的全新BioPerl; 安装BioPerl后出错,需要从头安装。 重新安装时不会自动覆盖老板本,因此需要手动删除以下文件: bioperl位于以下目录: /usr/local/man/man3/Bio::* /usr/local/bin/bp_* /usr/local/man/man1/bp_* … 阅读全文 →